磷脂酶是一种将磷脂酰胆碱、磷脂酰酰肌醇、磷脂酰乙醇胺等磷脂类物质水解的酶。磷脂酶是细胞膜磷脂的催化降解酶，可以将磷脂酰胆碱、磷脂酰酰肌醇、磷脂酰乙醇胺等磷脂类物质降解成溶解度低的磷脂酸、酰肌醇磷酸、酰乙醇胺等物质。
磷脂酶广泛存在于动植物的内脏器官中。在脑中是一种很常见的酶，磷脂酰胆碱酰化酶和磷脂酰肌醇酰化酶都属于磷脂酶家族，参与许多生理过程。其中磷脂酰胆碱酰化酶在神经系统中尤其重要。磷脂酷蛋白酶是一种对细胞内膜磷脂水解作用的内切酶。它不像磷脂酶A2那样能直接水解磷脂酰肌醇（PtdIns）。但磷脂酷蛋白酶可以把ω-6位与ω-3位之间的磷酸二酯水解，形成一种短酰基磷脂酸。
